Проверьте воспроизведение видео до сохранения.
Проиграйте весь проект видео в редакторе и проверьте, что видео и аудио синхронны.
Если видео и звук не синхронны в самом видеоредакторе, попробуйте закрыть все остальные приложения — проблема может быть результатом большой нагрузки на систему.
Если же видео и звук не синхронны, попробуйте отключить все доступные ускорения в меню Настройки - Параметры - Ускорения.
Также можно попробовать выбрать другой формат экспорта видео, например, MP4 с кодеком H.264 либо MPEG-4.